ギャグパートの裏側で静かに、しかし確実に進行していたのが「松下村塾」出身者たちの過酷な因縁だ。かつて攘夷戦争で「白夜叉」と恐れられた坂田銀時、狂乱の貴公子・桂小太郎、そして過激派攘夷志士の首領・高杉晋助。彼らはみな、恩師である吉田松陽の教えを受けた同門であった。
なぜかつての親友たちが、江戸を救う者と破壊を目指す者に袂を分かつことになったのか。その答えは、彼らが背負った悲劇的な過去と、松陽の正体に関わる巨大な秘密(虚の存在)に隠されている。ギャグ回で何気なく描かれていた会話や何気ない仕草が、終盤の「将軍暗殺篇」や「さらば真選組篇」において重い意味を持つ伏線へと昇華していく怒涛の展開は、読者の心を揺さぶり続けた。