赤信号を突破して上り列車が信楽駅を発車した後も、衝突を回避できる機会は複数回存在しました。しかし、両社間の通信指令の不備と情報連絡システムの断絶が、最後の防波堤をことごとく決壊させました。
信楽駅を発車した列車が小野谷信号場に接近した際、異常を察知した駅員や指令関係者は小野谷信号場を監視する制御盤を見て戦慄します。対向のJR西日本直通臨時快速「世界陶芸祭しがらき号」が、すでに小野谷信号場を通過して同じ単線区間へと進入していたのです。
事故対策本部の証言記録や法廷資料によれば、信楽駅側には列車無線が配備されていたものの、当時の運用体制では列車のブレーキを緊急遠隔作動させる手段はなく、無線呼出に対する運転士の応答も得られませんでした。さらに決定打となったのは、信楽高原鐵道とJR西日本の指令所間にダイレクトなホットライン（緊急直通電話）が機能していなかった点です。
JR西日本の亀山運転指令との間で電話がつながった時には、すでに衝突の瞬間が迫っていました。両者の運行管理責任が縦割りとなり、相互乗り入れという高度なオペレーションを行いながら「相手列車の位置をリアルタイムで双方が把握・制止できるフェイルセーフ」を構築していなかった怠慢が、回避可能だった正面衝突を現実のものにしてしまいました。
