藤村俊二さんは2017年1月25日、心不全のため東京都内の病院で息を引き取りました（享年82）。テレビで見せていた飄々とした姿の裏で、晩年は静かに自身の健康と向き合う日々を過ごしていました。
表舞台から姿を消した時期、ファンの間では重病説や認知症の噂など様々な憶測が飛び交いました。しかし実際には、血管系の疾患やパーキンソン病の疑い、加齢に伴う体力低下に対して無理な延命や過度な医療介入を望まず、自宅や療養施設で穏やかな時間を最優先に選択していたのが実情です。
最期を看取った長男の藤村亜実氏によると、亡くなる直前まで苦しむ様子はなく、眠るように息を引き取ったと明かされています。「格好悪い姿は誰にも見せたくない」という生涯一貫した美学を、最期の瞬間まで貫き通した旅立ちでした。
