入院生活をスタートさせるにあたり、多くの家族が直面するのが「費用」に関する疑問と手続きの複雑さです。有馬温泉病院における入院費用は、公的医療保険制度（健康保険・後期高齢者医療制度など）に基づく医療費と、食費・居住費、そして希望や病室タイプに応じた「差額ベッド代（特別療養環境室料）」で構成されます。
差額ベッド代は、大部屋（4人部屋等）であれば原則発生しませんが、個室や2人部屋を選択した場合は室料が1日単位で加算されます。回復期リハビリ病棟では集中的な休息を求めて個室を希望するケースもありますが、入院期間が2〜3か月に及ぶと総額に影響するため、事前の試算が欠かせません。
医療費の自己負担額を抑えるためには、入院が決まった段階で「限度額適用認定証」の申請を行うことが不可欠です。高額療養費制度を適用することで、月ごとの医療費窓口支払額を所得に応じた上限額に留めることができます。また、リハビリテーションで使用する各種装具代や日用品レンタル（アメニティセット）の費用についても、事前に医療ソーシャルワーカー（MSW）へ確認しておくことがトラブルを防ぐポイントです。
