山頂が県境未定であること以上に驚くべきは、富士山8合目以上の大部分が国有地ではなく「私有地」であるという事実だ。その所有者は、静岡県富士宮市に本社を置く富士山本宮浅間大社である。この特別な権利の根源は、関ヶ原の戦いに勝利した徳川家康にまでさかのぼる。
徳川家康は1606年、天下統一の感謝を込めて山頂部を富士山本宮浅間大社に寄進した。明治時代の国家管理化に伴い一時的に召し上げられたものの、長年にわたる訴訟を経て2004年に正式に神社へと所有権が返還された。国土地理院の土地登記においても、この神聖なエリアは神社境内地として明確に認められている。