桐蔭学園のアイデンティティを語る上で絶対に外せないのが、全国トップレベルを誇る部活動の実績です。共学化とコース再編を経た現在も、その圧倒的な強さは些かも揺らいでいません。
とりわけ全国にその名を轟かせているのが桐蔭学園高校のラグビー部です。全国高校ラグビー大会（花園）において幾度となく全国制覇を成し遂げ、日本代表選手やトップリーグ（リーグワン）で活躍するトップアスリートを数多く輩出し続けています。卓越した戦術眼と規律ある組織プレーは高校ラグビー界の最高峰と称され、全国の有力中学生がその門を叩きます。人工芝の専用グラウンドや充実したウェイトトレーニング施設など、大学や実業団にも引けを取らない練習環境が強さを支える原動力です。
また、甲子園優勝経験を持ち、数多くのプロ野球選手を世に送り出してきた桐蔭学園高校の野球部も、神奈川の激戦区で常に上位進出を狙う伝統校として存在感を放ち続けています。近年は激戦の神奈川大会を勝ち抜くため、効率的な科学的トレーニングとデータ分析を取り入れた指導体制が構築されています。
ここで重要なのは、これらの強豪運動部に所属する生徒の多くがスタンダードコースに籍を置き、競技に全力を注ぎながらも学業をおろそかにしない「文武両道」の規律を守っている点です。かつてのように「スポーツ推薦の生徒は勉強免除」といった甘い環境は一切なく、赤点を取れば遠征や試合出場が制限されるなど、人間形成を重視するアカデミックな指導が貫かれています。
