視聴者の間で最も深刻な誤解を生みやすいのが、「国民が善意で投じた募金の中からタレントのギャラが支払われているのではないか」という疑惑です。この点について、日本テレビおよびチャリティー委員会は厳格な資金分離を行っています。
番組を通じて集まった一般からの寄付金は、すべて「公益社団法人24時間テレビチャリティー委員会」に直接集約されます。この資金は福祉車両の贈呈、災害復興支援、環境保護活動、貧困支援などに1円単位まで全額が使途公開されており、番組制作費やタレントの出演料に流用されることは制度上あり得ません。
では、ランナーのギャラや番組の制作費はどこから出ているのかといえば、それはすべてナショナルスポンサー各社が支払う広告出稿料（電波料・タイム枠提供料）です。通常の民放番組と同様に、企業が支払った広告宣伝費から制作費が捻出され、その中から出演者への対価が支払われます。
日本テレビ側が個別のギャラ額を公式発表しない理由は、民間企業同士の機密保持契約（NDA）に該当するためであり、民放の商習慣として通常のバラエティやドラマと同一の扱いをしているからです。しかし、「チャリティー」を大々的に掲げる番組である以上、この商業構造と善意のコントラストが視聴者の不信感を招く要因となっています。
