東京メトロの初期発表によると、今回のトラブルの引き金となったのは、清澄白河駅〜水天宮前駅間に設置された最新型信号制御システムの突発的な通信障害である。安全装置が自動で作動し、全線で信号が赤に固定されたため、安全確認のために直ちに全列車の運行が停止された。
2026年現在、半蔵門線ではデジタル制御による高密度ダイヤが導入されており、前後の列車間隔が極限まで詰められている。そのため、わずか1箇所のシステム不具合であっても、全線にわたる非常停止措置を取らざるを得ない構造的リスクを抱えていた。現場には保線員とシステムエンジニアが緊急出動し、機器の再起動と手動バイパス回路の構築作業を進めたが、混雑する時間帯も手伝って復旧作業は難航を極めた。
