沖縄の食卓を知り尽くしたサンエーならではの強みは、生鮮食品売り場でいかんなく発揮されている。野菜コーナーに足を踏み入れると、地元の契約農家から毎朝届く新鮮なゴーヤー、シブイ(冬瓜)、島とうがらしがみずみずしく並ぶ。近年注力されているオーガニック野菜や島野菜の特別枠も拡大された。
鮮魚・精肉エリアのこだわりも圧巻だ。近海で水揚げされた新鮮なマグロやセーイカ、深い味わいが魅力の県産アグー豚や山城牛が美しくディスプレイされている。夕方のピークタイムには、旬の食材を買い求める地元の主婦や料理人たちで熱気に包まれる。